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4种牛奶中线粒体基因组的序列测定及Passiform线粒

发布日期:2019-02-11 19:20 浏览次数:80

4种牛奶中线粒体基因组的序列测定及Passiform线粒体菌株的基因组分析
林莲
【摘要】麻雀眼数量多,个体数量多,形态多样,辐射丰富,鸟类的分类和系统发育研究占据了鸟类学研究的重要组成部分。是的。
由于分子生物学的发展和计算机技术的应用,越来越多的DNA数据被用于Pascelin的分类和系统发育分析。
线粒体的几个基因(例如,细胞色素b,色柱,12 SrRNA,16 SrRNA,ND1,ND2,等等)已经研究了鸟的形式的分类和不同次数的系统发育和类群。
然而,由于线粒体中不同基因的进化速率不同,它们的系统发育信息不同,遗传树不一致的现象也随之出现,逐渐成为最重要的基因树之一。研究表明。分子系统发育重建很困难。
由于线粒体基因组包含更多信息,因此可能更有可能对实际的系统发育关系做出反应。
截至2011年4月,NCBI GenBank数据库包含144个关于鸟类的完整线粒体基因组数据,其中只有24个是麻雀眼鸟的完整线粒体基因组数据。
在该研究中,Paruscyanus,Parusmajor,Parusmonticolus和Paruspalustris的线粒体基因组的完整序列通过长PCR扩增和用引物步行来确定。
对四种鸟类线粒体基因组进行注释,并与鸡,斑马,otogi和巨柚的线粒体基因组结合进行分析。
此外,本研究结合GenBank数据库的现有数据,对雀形目线粒体基因的系统发育和功效进行了初步探讨。
获得的主要结果如下。
山雀,山雀,山雀和湿地的线粒体基因组总长度分别为16,788 bp,16,773 bp,16,772 bp和16,783 bp的13个蛋白质编码基因。rRNA基因,22个tRNA基因和1个未编码的对照区域。
2. 4只鸟的整个线粒体基因组的基本组成没有明显的A + T偏差。
ND6基因的碱基组成与其他12种蛋白质编码基因不同,C碱基含量显着降低。
在四个受控区域中,G基含量显着降低。
在4只鸟的tRNA Ser(AGY)的二级结构中发现了DHU臂的缺失现象。tRNA的另外两个二级结构显示出与三叶草相似的典型结构。
对12S rRNA和16S rRNA的二级结构进行了初步预测。
结果表明,几个12S rRNA基因的二级结构可分为4个区域,包括47个茎区; 16S rRNA基因的二级结构可分为6个区域,包括60个干区域是的。
5.分析Passerine控制区保守中心区,B-Fbox和Birdsimilaritybox的初步描述。
此外,在对照区域未发现哺乳动物中重链(OH)的复制起点序列。
6.利用线粒体基因组分裂和整合的五个数据集,使用三种方法(MP方法,ML方法和BI方法),支持同性恋和麻雀目的的小目标分析鸟类的系统发育分析。单一系统。
江东不是一只叫亚明的鸟,它不是一只歌唱的鸟,它被认为不是一群唱歌的鸟儿。
7.通过对基因有效性的研究,完整线粒体基因组序列,rRNA组合和编码该蛋白的基因的组合数据被认为在系统发育树重建中具有更高的效率。
对于单个基因,ND5,ND1和16S rRNA基因具有更多的系统发育信息。
[补助单位]:陕西师范大学[等级]:硕士学位[获奖年份]:2011年[分类编号]:Q75
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